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用于單分子長讀取測序的高分子量基因組DNA的提取方法
點擊次數:2534 更新時間:2016-11-24

復雜基因組從頭測序是研究人員尋求高質量參照序列的主要挑戰之一,許多從頭組裝都是基于短序列,組裝成片段的基因組序列。第三代測序技術的讀取長度大于10 Kb,這將有利于復雜基因組的組裝,但是這些技術要求高分子量的基因組DNA,常用的基因組DNA提取方法所提取到的基因組DNA可用于獲取較小片段并進行短讀取測序,但是這些基因組DNA并不適用于第三代測序技術。利用細菌人工染色體構建基因文庫的方法也許適用,但是這些方法不但耗時,而且用于這些方法的試劑盒較為昂貴。這里,法國科學家Baptiste Mayjonade等人提供了一種快速廉價的從細菌、植物和動物中提取高分子量基因組DNA的方法。這一方法已通過驗證,以向日葵葉子為樣本,其平均讀取長度為12.6 Kb,zui大讀取長度為80 Kb。

 原文:

Baptiste Mayjonade, Jérôme Gouzy, Cécile Donnadieu et al, Extraction of high-molecular-weight genomic DNA for long-read sequencing of single molecules. BioTechniques 61:203-205 (October 2016).